《有史以前的日本》(1925)
《从人类学上看我国上古的文化》(1929)
《从考古学上看辽的文化》等。他的全部论著都收入在十二卷的《鸟居龙藏全集》(1975)之中。
《史前期的日本》
《千岛阿伊努人》
《苗族调查报告》
《东北亚人类学人种学问题》
《极东民族》等等。
1975-1976年朝日新闻社出版《鸟居龙藏全集》12卷。